В смысле? Просто открыть и сохранить как Jpeg с таким же именем? Так элементарно, запиши любую команду. Ну например flatten.
Потом через image prosessor запусти этот экшен в папке.
А можешь и не писать экшена, просто папку укажи где брать и куда складывать.
А если тебе просто надоело каждый раз сохранять как... то сделай, как я. Напиши экшен в 1 строку - сохранить как Jpeg, но оставь окошко диалога. Потом назначь клавишу, например F4. Будешь просто f4 нажимать и энтер, если имя менять не надо.